Los microbios vegetales se definen como el estudio de los organismos y las condiciones ambientales que causan enfermedades en las plantas, los mecanismos por los cuales esto ocurre, las interacciones entre estos agentes causales y la planta (efectos sobre el crecimiento, el rendimiento y la calidad de las plantas). Los organismos que causan enfermedades infecciosas incluyen hongos, oomicetos, bacterias, virus, viroides, organismos similares a virus, fitoplasmas, protozoos, nematodos y plantas parásitas. La patología vegetal también implica el estudio de la identificación de patógenos, la etiología de las enfermedades, los ciclos de las enfermedades, el impacto económico, la epidemiología de las enfermedades de las plantas y la resistencia a las enfermedades de las plantas.