El diagnóstico de microorganismos patógenos es por examen y técnicas directas. La inmunofluorescencia, la tinción con inmunoperoxidasa y otros inmunoensayos pueden detectar antígenos microbianos específicos. Las sondas genéticas identifican secuencias de ADN o ARN específicas de un género o especie.
Cultivo: Los medios no selectivos (no inhibidores) y los medios selectivos contienen sustancias inhibidoras.
Serodiagnóstico: título creciente de anticuerpos IgG específicos o presencia de anticuerpos IgM específicos.