Los hongos microbianos son la mayoría de los hongos fitopatógenos que pertenecen a los ascomicetos y los basidiomicetos. Los hongos patógenos biotróficos colonizan el tejido vegetal vivo y obtienen nutrientes de las células huésped vivas. Las enfermedades fúngicas están más extendidas y son más destructivas que otras enfermedades de las plantas; disminuyen significativamente las cosechas y la calidad de los cultivos, y acortan la vida productiva de los árboles frutales y los campos de bayas.