Metabolito es cualquier sustancia producida durante el metabolismo. El metabolismo microbiano es el medio por el cual un microbio obtiene la energía y los nutrientes que necesita para vivir y reproducirse. Un metabolito primario es un tipo de metabolito directamente involucrado en el crecimiento, desarrollo y reproducción normales. Los metabolitos secundarios son compuestos orgánicos que no participan directamente en el crecimiento, desarrollo y reproducción normales del organismo.