Medicina molecular y genética

El papel de la variación del número de copias en afroamericanos con enfermedad renal terminal asociada a diabetes tipo 2

Abstract

Jessica N. Cooke Bailey, Lingyi Lu, Jeff W. Chou, Jianzhao Xu, David R. McWilliams, Timothy D. Howard, Barry I. Freedman, Donald W. Bowden, Carl D. Langefeld y Nicholette D. Palmer

Este estudio investigó la asociación de las variantes del número de copias (CNV) en la diabetes tipo 2 (DT2) y la enfermedad renal en etapa terminal (ESRD) asociada a la DT2 en afroamericanos. Utilizando la matriz Affymetrix 6.0, se interrogaron más de 900.000 sondas CNV que abarcaban el genoma en 965 afroamericanos con DT2-ESRD y 1029 controles afroamericanos no diabéticos. Las CNV previamente identificadas y las nuevas se analizaron por separado y se evaluaron para determinar el estado de inserción/deleción y luego se usaron como predictores en un modelo de regresión logística para probar la asociación. Una inserción común de CNV en el cromosoma 1 se asoció significativamente con DT2-ESRD (p = 6,17 × 10-5, OR = 1,63) después de la corrección de comparación múltiple. Esta región CNV abarca los genes AMY2A y AMY2B, que codifican isoenzimas de amilasa producidas por el páncreas. También se detectaron CNV adicionales comunes y novedosos que se acercaban a la significación con la enfermedad. Estos resultados exploratorios requieren una mayor replicación, pero sugieren la participación de la CNV AMY2A/AMY2B en la diabetes tipo 2 y/o la enfermedad renal terminal con diabetes tipo 2, e indican que las CNV pueden contribuir a la susceptibilidad a estas enfermedades.