Medicina molecular y genética

El efecto de la mutación NOP16 en la leucemia linfocítica crónica

Abstract

Fernández-Martínez JL, De Andrés-Galiana EJ y Cernea A

NOP16 fue la tercera mutación más importante (6,84%) en una cohorte de tamaño reducido de 117 pacientes con leucemia linfocítica crónica (LLC) cuyas mutaciones más recurrentes fueron NOTCH1 (9,4%) y SF3B1 (8,55%). En este trabajo analizamos el efecto de la mutación NOP16 en la expresión génica. La mutación NOP16 se predijo con un 100% de precisión utilizando una firma a pequeña escala formada por los 26 genes con el índice de Fisher más alto. SLC39A4 ( ZIP4 ) y WARS son los genes más discriminatorios de esta mutación proporcionando una precisión predictiva del 97,4%. El análisis Fold Change también confirmó un papel muy importante de las inmunoglobulinas de cadena ligera ( IGKV3D-11 , IGKC e IGLJ3 ) y pesada (IGHG1), SOX11 , CCND1 y CHL1 . Este análisis también destaca la importancia de varios mecanismos como la apoptosis relacionada con ZIP4 , la relación de sobreexpresión de SOX11 - CCND1 observada en el linfoma de células del manto, y la regulación negativa y sobreexpresión de CHL1 del factor promotor del crecimiento de neuritas midkina que mejora las actividades angiogénicas y proliferativas de las células cancerosas en diferentes tipos de cánceres sólidos. Además, el análisis de estabilidad de retención ha demostrado la importancia de los eventos de señalización del receptor de células B (BCR), la señalización de P53, la enfermedad infecciosa y la señalización del receptor TGF-beta. La integración de la mutación NOP16 con las mutaciones IgHV, NOTCH1 y SF3B1, que se analizaron previamente, confirmó que estas mutaciones solo comparten dos genes altamente discriminatorios: IGHG1 y RGS13. Estos genes están involucrados en diferentes mecanismos relacionados con la señalización y el sistema inmunológico. Este análisis abre una nueva hipótesis de trabajo para el tratamiento y pronóstico de la LLC.