Medicina molecular y genética

predicción de la unión de péptidos de clase MHC y de aglutinantes TAP de alta afinidad para diseñar una vacuna peptídica sintética de neurotoxina larga 3 de Naja naja

Abstract

Sherkhane AS, Changbhale SS y Gomase contra

Naja naja es una especie de serpiente cobra altamente venenosa de la familia Elapidae y se encuentra común en Asia central. La neurotoxina larga 3 de Naja naja se une a los receptores nicotínicos de acetilcolina en la membrana postsináptica, lo que evita la unión de la acetilcolina y bloquea la excitación de los músculos. Los péptidos antigénicos son biomoléculas complejas que tienen propiedades químicas y físicas únicas que resultan de su composición de aminoácidos. En este estudio, hemos predicho la afinidad de unión de la neurotoxina larga 3 de Naja naja que tiene 71 aminoácidos, lo que muestra 63 nonámeros. Los fragmentos peptídicos de la neurotoxina se pueden utilizar para seleccionar nonámeros para su uso en el diseño de vacunas de péptidos sintéticos y para aumentar la comprensión de las funciones del sistema inmunológico en los estudios de neurotoxinas. Los péptidos antigénicos de la neurotoxina larga 3 de Naja naja son los más adecuados para el desarrollo de vacunas de péptidos sintéticos porque con el segmento pequeño '15-PNGHVCYTKT-24, 26-CDAFCSIRG-34, 36-RVDLGCAATCPTVKTGVDIQCCSTD-60 llamado epítopos antigénicos es suficiente para provocar la respuesta inmune deseada. En esta investigación, predecimos el péptido de unión de clase I y II de MHC porque las moléculas de MHC son proteínas de la superficie celular que participan activamente en la respuesta inmune, la antigenicidad, la accesibilidad a solventes, los residuos polares y no polares que probablemente estén expuestos en la superficie de las proteínas que son potencialmente antigénicas que permiten diseñar una vacuna de péptidos sintéticos.