Medicina molecular y genética

Análisis molecular de especies de Erwinia basado en secuencias del gen 16S rDNA

Abstract

Ahmad I Funjan*

Los métodos tradicionales de identificación de las Erwinias de podredumbre blanda son imprecisos y requieren mucho tiempo. Hemos utilizado el 16S rDNA para ayudar en su identificación.
El análisis del 16S rDNA-PCR y del 16S rDNA-RFLP y la secuenciación de genes resultaron ser métodos simples, precisos y rápidos en comparación con otras técnicas moleculares.
El análisis del genoma de los aislados utilizando su ADN total mediante la amplificación de su genoma utilizando el cebador universal (fD1/rP2) indicó un producto amplificado del
16S rDNA a 450 pb y la amplificación utilizando el 16S rDNA específico (EP16A/EP1GTC) se ubicó en 700 pb. El análisis de restricción del
producto amplificado universal de 450 pb utilizando Hind III, demostró la presencia de diferentes bandas RFLP con algunas bandas comunes. La variación en las bandas del perfil RFLP es una indicación de
polimorfismo entre los aislados. Mientras que las bandas comunes indican estabilidad genética entre los aislamientos de las mismas especias o del mismo género. La secuenciación del
producto amplificado con el cebador universal 16S rDNA mostró una secuencia completa de un aislamiento de cada 10 aislamientos y la similitud entre este aislamiento y la base de datos
indicó la presencia de una alta similitud por encima del 95% con otras Enterobaceriaceae.