Medicina molecular y genética

Identificación de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) de Enterococcus fecal aislado de pacientes nigerianos seropositivos al VIH con células CD4 + de <200 células/μl: un posible objetivo de la vacuna

Abstract

Ehiaghe Friday Alfred1*, Ehiaghe Imuetinya Joy2, Rebecca Chinyelu Chukwuanukwu1, Onah Ejike Christian1, Ihim Augustine Chinedu1, Ochiabuto Mary-Theodora Ogochukwu1, Unaeze Chukwuebuka Bright1, Obi Chioma Maureen1, Ukibe Rose Nkiruka1, Osakue Omoyemen Nosahkare1, Onyenekwe Charlse Chinedum1, Meludu Chukwuemeka Samuel1, Manafa Patrick Onochie1 y Emeje Paul Isaac3

Los enterococos han adquirido importancia como causa de infecciones nosocomiales. Se presentan como contaminantes de los alimentos y también se han relacionado con enfermedades dentales. Actualmente, la endocarditis infecciosa (EI) causada por Enterococcus faecalis representa el 10% de todas las EI y se caracteriza por su difícil manejo y la frecuencia de recaídas. Aunque las razones precisas de esto aún están por dilucidar, la evolución de la cepa culpable basada en el polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) podría estar involucrada, al menos en parte. El estudio transversal seleccionó aleatoriamente a 40 pacientes seropositivos al VIH que dieron su consentimiento (25 hombres y 15 mujeres) e índice de masa corporal de 16,7 ± 1,0 (Kg/m2 ) con células CD4+ <200 células/µl. Se recogieron muestras de orina y heces que se utilizaron para las pruebas. Se utilizó agar cromo para el aislamiento bacteriano. Los aislamientos de ADN de los cultivos de crecimiento de 24 horas de posible Enterococcus faecalis se llevaron a cabo utilizando el kit de aislamiento de ADN bacteriano de Zymo Research. Los veintinueve (29) aislamientos clínicos que mostraron colonias de color negro fueron sometidos a una identificación por reacción en cadena de la polimerasa utilizando cebadores específicos del gen Enterococcus faecalis . Solo dos (2) de veintinueve (29) Enterococcus spp sospechosos fueron confirmados por PCR Enterococcus faecalis . Observamos que alrededor del 85,36313% de los sitios de las accesiones son polimórficos entre los dos aislamientos. Considerando el gen Enterococcus faecalis los sitios polimórficos son 76,4% y 23,6% bialélicos y trialélicos respectivamente con un número correspondiente de tales sitios como 447 y 331, respectivamente. Las regiones codificantes (CD) del genoma de Enterococcus faecalis mostraron la mayoría de los loci de SNP en las posiciones de codón C2 y C3 con el 34,5% y el 31,3% de sus respectivos loci de SNP totales, respectivamente. La variabilidad observada entre las dos secuencias de Nigeria puede deberse a una mayor diversidad genética a lo largo del tiempo y podría ser un posible objetivo de la vacuna en la prevención de la endocarditis infecciosa (EI) causada por Enterococcus faecalis .