Medicina molecular y genética

Expresión altamente variable de variantes de empalme de ESR1 en el hígado humano: implicación en la regulación de la expresión génica hepática y variabilidad interpersonal en el metabolismo de fármacos y enfermedades hepáticas

Abstract

Sun JW, Collins JM, Ling D y Wang D

El receptor de estrógeno alfa ( ESR1 ) desempeña un papel importante en muchos tejidos, incluido el hígado. Existen numerosas variantes de empalme alternativo de ESR1 que codifican proteínas ESR1 con funciones variables. Nuestro objetivo es estudiar la organización genómica de ESR1 y su perfil de expresión de ARNm en el hígado humano incorporando información de la literatura y bases de datos genómicas (Ensembl, NCBI y GTEx), y empleando un método cuantitativo para medir todas las variantes de empalme de ARNm de ESR1 conocidas en 36 hígados humanos. Reconstruimos el mapa de organización genómica de ESR1 que contiene 29 exones. Las variantes de empalme de ARNm de ESR1 con una región 5' no traducida (5'UTR) variable y/o la falta de cada uno de los ocho exones codificantes son fácilmente detectables en el hígado y otros tejidos. Además, encontramos una amplia variabilidad interindividual en el patrón de variantes de empalme de las transcripciones de ESR1 . En concreto, las transcripciones de ESR1 que carecen del primer exón codificante son las principales transcripciones en el hígado, que codifican proteínas ESR1 que carecen de 173 aminoácidos N-terminales (por ejemplo, ERα46), que se ha informado anteriormente que tienen actividad constitutiva o efectos negativos dominantes según el contexto celular. Además, algunos hígados expresan predominantemente transcripciones de ESR1 que carecen del exón 10 o 16, que codifican proteínas ESR1 truncadas C-terminales con actividades ESR1 variables . La variabilidad interpersonal en el perfil de expresión de ESR1 puede contribuir a la variabilidad interpersonal en el metabolismo de fármacos y la susceptibilidad a enfermedades relacionadas con el hígado.