Medicina molecular y genética

Detección de mutaciones de IDH1 e IDH2 en pacientes con leucemia mieloide aguda mediante nuevos ensayos de PCR en tiempo real de alta sensibilidad y rápido tiempo de respuesta

Abstract

Dash DP, Wise L, Knier A, Boretsky M, Simons J, Berchanskiy D, Indig MA y Joseph AM

Las mutaciones de la isocitrato deshidrogenasa 1 y 2 ( IDH1/IDH2 ) son frecuentes en la leucemia mieloide aguda (LMA). Aquí describimos los ensayos Abbott Real -Time IDH1 e IDH2 basados ??en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) cualitativa , que detectan variantes de un solo nucleótido que codifican cinco mutaciones de IDH1 y nueve de IDH2 . Evaluamos la sensibilidad y especificidad de los ensayos Abbott Real-Time IDH1/IDH2 y realizamos un análisis de flujo de trabajo que los comparó con los ensayos de Sanger y secuenciación de próxima generación (NGS) basados ??en PCR en muestras de sangre o médula ósea de 100 pacientes con LMA. La secuenciación de Sanger y la NGS detectaron mutaciones de IDH con límites de sensibilidad de alelos variantes del 20% y 10%, respectivamente. Los ensayos Abbott Real-Time IDH1/IDH2 demostraron una sensibilidad del 100% y una especificidad del 95% frente a la secuenciación de Sanger y detectaron mutaciones al nivel del 1%. Se detectaron mutaciones de bajo nivel de IDH2 en cinco muestras mediante el ensayo Abbott Real-Time IDH2 , pero no mediante la secuenciación de Sanger. El tiempo de respuesta (TAT) basado en un análisis del flujo de trabajo mostró que los resultados del ensayo Abbott Real-Time IDH1/IDH2 estaban disponibles en tres días hábiles, en comparación con los ocho días para la secuenciación de Sanger y los 15 días para la secuenciación de nueva generación. Una mayor sensibilidad y un TAT rápido para detectar mutaciones de IDH pueden mejorar la identificación de pacientes con una carga menor de IDH mutante y permitir una administración más rápida de los inhibidores de IDH aprobados por la FDA , Ivosidenib y Enasidenib.