Medicina molecular y genética

Análisis comparativo de genes de ARN intrónico no codificante entre organismos

Abstract

Kondo Y, Hayashi C y Miyazaki S

El desarrollo de técnicas de secuenciación nos ha permitido determinar secuencias genómicas en muchos organismos. Un genoma determinado de este tipo no solo consta de genes codificadores de proteínas, sino también de genes de ARN no codificante (ARNnc). Deberíamos analizar las historias evolutivas de dichos genes para estimar las direcciones evolutivas en el futuro. Mientras tanto, estudios recientes mostraron que algunos genes de ARNnc se encuentran en regiones intragénicas en genes codificadores de proteínas, que se denominan genes del huésped. Consideramos que dicha información puede ayudarnos a analizar las evoluciones de los genes. En este estudio, construimos una base de datos para analizar las evoluciones de los genes codificadores y no codificantes de proteínas en función de las ubicaciones de los genes en las secuencias genómicas. Descubrimos que 547 de los 2691 genes del huésped humano son ortólogos de 546 de los 1633 genes del huésped del ratón. Dichos genes del huésped ortólogo participan en funciones biológicas similares, pero algunos genes del huésped no ortólogos tienen funciones diferentes. Por ejemplo, los genes del huésped no ortólogos en humanos se anotan como términos relacionados con las neuronas, pero dichos genes en el ratón no lo son. Mientras tanto, las búsquedas de similitud de genes de microARN intrónicos (miARN) entre humanos y ratones mostraron que 85 de los genes ortólogos del huésped han conservado genes de miARN en las regiones intrónicas. 64 de estos genes han conservado genes de miARN intrónicos entre humanos, ratones y ratas. Estos resultados sugieren que algunos genes ortólogos han conservado genes de ncARN en las regiones intrónicas en el proceso evolutivo.