Medicina molecular y genética

Un estudio sobre la divergencia evolutiva de los elementos promotores centrales de PRPF31 y TFPT

Abstract

Anna M Rose, Amna Z Shah, Giovanna Alfano, Kinga M Bujakowska, Amy F Barker, J Louis= Robertson, Sufia Rahman, Lourdes Valdés Sánchez, Francisco J Diaz-Corrales, Christina F Chakarova, Abhay Krishna y Shomi S Bhattacharya

Las mutaciones en PRPF31 se han relacionado con la retinitis pigmentosa, una enfermedad que produce ceguera y que se produce por la degeneración de los fotorreceptores de bastón. El mecanismo de la enfermedad en la mayoría de los casos es la haploinsuficiencia. Fundamentalmente, los intentos de generar modelos animales de la enfermedad han resultado infructuosos, obteniéndose animales con un fenotipo visual que no refleja la enfermedad humana. Esto sugiere que, en estos animales, la regulación transcripcional de PRPF31 es diferente a la de los humanos y en comparación con otras especies. El estudio de la evolución del promotor central de PRPF31 tiene implicaciones importantes para nuestra comprensión de la enfermedad humana, ya que el fenotipo de la enfermedad se modifica por alelos expresados ??diferencialmente en la población.

El PRPF31 se encuentra en una disposición de cabeza a cabeza con el TFPT, un gen involucrado en la apoptosis celular. Se demostró que los dos genes comparten elementos reguladores comunes en el genoma humano. En este estudio, los promotores centrales del PRPF31 y del TFPT se caracterizaron mediante un ensayo de doble luciferasa usando ADN genómico del mono verde, el perro doméstico y el ratón doméstico. Se descubrió que los promotores centrales se conservaban entre el ser humano y el mono.

En el perro, el promotor central TFPT estaba conservado, pero la diferente arquitectura del gen PRPF31 significaba que el gen estaba controlado por un promotor de largo alcance ubicado a unos 2000 pb del sitio de inicio de la transcripción.

Se observó un nivel muy bajo de conservación (<20%) de la región 5' de PRPF31 entre ratones y humanos. Se demostró que las poblaciones de ratones no mostraron niveles variables de expresión de Prpf31, lo que revela una posible explicación de la falta de fenotipo observada en el modelo de ratón knock-out de Prpf31.