Revista de genética e investigación del ADN.

Análisis de transcriptomas de verrugas inducidas por VPH y piel sana en humanos: un estudio exploratorio

Abstract

Laith N. Al-Eitan1,2*, Amneh H. Tarkhan1, Mansour A. Alghamdi3, Firas A. Al-Qarqaz4,5, Hadeel S. AlKofahi4,

Conocidos por ser la causa de los lunares en los seres humanos, los virus del papiloma humano (VPH) son un grupo irresistible de infecciones de ADN que se transmiten entre personas a través del contacto piel con piel. Debido a que los lunares se encuentran en el 7 al 12% de la población, la infección por VPH es una enfermedad generalmente común que afecta a aproximadamente 1 de cada 10 personas a lo largo de su vida. Tras una revisión amplia de los escritos generales, se descubrió que ningún artículo exploraba los perfiles de expresión de calidad de los lunares provocados por el VPH. El objetivo principal de esta investigación es determinar si existe una diferencia en los perfiles de expresión de calidad de los lunares y la piel sana en personas con VPH+. La tecnología de secuenciación de ARN se utilizó sin precedentes en Jordania para determinar si existe una diferencia en la expresión de calidad entre los lunares provocados por el VPH y la piel sana. Las correlaciones entre los lunares provocados por el VPH y la piel sana de pacientes árabes jordanos se completaron utilizando el sistema de secuenciación Illumina HiSeq 2500. Se utilizaron diferentes programas de bioinformática para la medición de la expresión diferencial, la investigación de la mejora del conjunto de calidad, el examen de vías y la agrupación de mapas de calor. Se descubrió que los lunares activados por el VPH tenían una marca genética muy grande y excepcional. Un número significativo de las cualidades dirigidas hacia arriba se asociaron con el cáncer y la infección (WIF1, HMGCS2, CLU y PTGIS), mientras que algunas cualidades controladas hacia abajo se asociaron con el bloqueo de la calidad (SPINK6, PI3, SERPINB4, SERPINB3). Además, se descubrió que las 500 cualidades comunicadas diferencialmente principales estaban relacionadas con las vías inmunes e inmunitarias, por ejemplo, la desgranulación de neutrófilos, la vía del receptor similar al costo 7/8 (TLR 7/8), la vía del receptor similar al costo 9 (TLR9) y la vía del receptor similar al costo 10 (TLR10), entre otras. Los lunares inducidos por el VPH tienen un diseño de articulación de calidad inconfundible que los distingue de la piel sana, pero que comparte muchas características prácticas con otras enfermedades de la piel. Las futuras líneas de investigación deben explorar las características de interés reveladas en esta investigación de forma individual para determinar el grado de su patogenicidad. El virus del papiloma humano (VPH) es una infección del ADN que se ha relacionado con numerosas enfermedades y es la causa completa de prácticamente todos los casos de cáncer de cuello uterino. Se han descrito casi 200 tipos de VPH, y estos tipos se denominan de alto riesgo o generalmente inocuos según su capacidad para causar lesiones destructivas o benignas, respectivamente. El 4,5% de los nuevos casos de enfermedad en general son causados ??por la infección por VPH de alto riesgo, pero los tipos generalmente inocuos suelen aparecer como lunares. Los lunares comunes (Verruca vulgaris) son, con un amplio margen, el tipo de lunar más común, ya que representan el 70% de todos los lunares cutáneos no genitales, y se cree que son de naturaleza benigna. La piel humana está formada por dos capas, la epidermis y la dermis, y el VPH sólo se centra en la capa epidérmica más inferior, la capa basal.para establecer una enfermedad tenaz, después de lo cual captura el proceso de separación de los queratinocitos con el objetivo final del ciclo de vida viral beneficioso. En consecuencia, la ciencia del VPH varía en queratinocitos basales y suprabasales, los últimos de los cuales están asociados con varias fases de separación epitelial. Los queratinocitos constituyen el 90% de cada célula epidérmica, y las molestias por su separación hacen que la piel sea más vulnerable a la infección y la enfermedad. En la actualidad, no existe cura para el VPH en sí, y su tratamiento se centra en el alivio de los síntomas clínicos hasta que la enfermedad se elimine por completo del sistema inmunitario. Sin embargo, no hay evidencia convincente sobre si la infección se elimina por completo del cuerpo o se reduce esencialmente a niveles imperceptibles. Si bien se han dedicado muchos estudios a las características genéticas de los cánceres relacionados con el VPH, existe una falta de información sobre la base genética de los lunares cutáneos no genitales, lo que demuestra una necesidad imperiosa de comprender mejor su etiología. Por lo tanto, el objetivo del presente estudio es proporcionar una correlación de todo el genoma de los transcriptomas de los lunares básicos y la piel normal utilizando la secuenciación de vanguardia. La presente investigación sirvió para explicar la base genética de la infección por VPH con respecto a los lunares cutáneos no genitales. Los hallazgos del presente estudio mostraron la desregulación de varias cualidades que pueden desempeñar un papel fundamental en el desarrollo de los lunares, incluidos KRT16, EPGN, C15orf59, CYB561A3 y FCGRT. Se descubrió que las vías relacionadas con el sistema inmune estaban relacionadas con diferentes cualidades de DE, incluida la desgranulación de neutrófilos, el factor de separación mieloide 88 y los receptores similares a los costos. Nuestros datos también sugieren que algunas cualidades involucradas en la respuesta inmune pueden desempeñar un papel fundamental en el fomento del proceso de infección por VPH. De hecho, el estudio de la firma de células inmunes mostró niveles de actividad distintivos de varias células asociadas con el sistema inmune, incluidas las células NKT, DC y Treg. Una gran cantidad de las características que se descubrió que estaban involucradas de manera similar a los lunares no fueron objeto de investigaciones evaluadas por colegas anteriores, lo que recomienda títulos y líneas de investigación futuras que se centren en esas características individuales, así como en los patrones de expresión de los diferentes tipos de VPH.y su tratamiento se centra en el alivio de los síntomas clínicos hasta que la enfermedad se elimina por completo del sistema inmune. Sin embargo, no hay evidencia convincente sobre si la infección se elimina por completo del cuerpo o se reduce esencialmente a niveles imperceptibles. Si bien se han dedicado muchos estudios a las características genéticas de los cánceres relacionados con el VPH, existe una falta de información sobre la base genética de los lunares cutáneos no genitales, lo que muestra una necesidad imperiosa de comprender más fácilmente su etiología. Por lo tanto, el objetivo del presente estudio es proporcionar una correlación de todo el genoma de los transcriptomas de los lunares comunes y la piel normal utilizando secuenciación avanzada. La presente investigación sirvió para explicar la base genética de la infección por VPH con respecto a los lunares cutáneos no genitales. Los hallazgos del presente estudio incluyeron la desregulación de varias características que pueden desempeñar un papel fundamental en el desarrollo de los lunares, incluidos KRT16, EPGN, C15orf59, CYB561A3 y FCGRT. Se descubrió que las vías relacionadas con el sistema inmune estaban relacionadas con diferentes características de DE, incluyendo la desgranulación de neutrófilos, el factor de división mieloide 88 y los receptores similares a los costos. Nuestros datos también sugieren que algunas características involucradas con la respuesta inmune pueden desempeñar un papel fundamental en el fomento del proceso de infección por VPH. De hecho, el estudio de la firma de células inmunes mostró niveles de actividad distintivos de varias células asociadas con el sistema inmune, incluyendo las células NKT, DC y Treg. Muchas de las características que se descubrió que estaban involucradas en lunares similares no fueron objeto de estudios evaluados previamente por amigos, lo que sugiere futuras direcciones y líneas de investigación que se centren en esas características individuales, así como en los patrones de expresión de los diferentes tipos de VPH.y su tratamiento se centra en el alivio de los síntomas clínicos hasta que la enfermedad se elimina por completo del sistema inmune. Sin embargo, no hay evidencia convincente sobre si la infección se elimina por completo del cuerpo o se reduce esencialmente a niveles imperceptibles. Si bien se han dedicado muchos estudios a las características genéticas de los cánceres relacionados con el VPH, existe una falta de información sobre la base genética de los lunares cutáneos no genitales, lo que muestra una necesidad imperiosa de comprender más fácilmente su etiología. Por lo tanto, el objetivo del presente estudio es proporcionar una correlación de todo el genoma de los transcriptomas de los lunares básicos y la piel normal utilizando secuenciación avanzada. La presente investigación sirvió para explicar la base genética de la infección por VPH con respecto a los lunares cutáneos no genitales. Los hallazgos del presente estudio incluyeron la desregulación de varias características que pueden desempeñar un papel fundamental en el desarrollo de los lunares, incluidos KRT16, EPGN, C15orf59, CYB561A3 y FCGRT. Se descubrió que las vías relacionadas con el sistema inmune estaban relacionadas con diferentes características de DE, incluyendo la desgranulación de neutrófilos, el factor de desprendimiento mieloide 88 y los receptores similares a los costos. Nuestros datos también sugieren que algunas características involucradas con la respuesta inmune pueden desempeñar un papel fundamental en el fomento del proceso de infección por VPH. De hecho, el estudio de la firma de células inmunes mostró niveles de actividad distintivos de varias células asociadas con el sistema inmune, incluyendo las células NKT, DC y Treg. Muchas de las características que se descubrió que estaban involucradas en lunares similares no fueron objeto de estudios evaluados previamente por amigos, lo que sugiere futuras direcciones y líneas de investigación que se centren en esas características individuales, así como en los patrones de expresión de los diferentes tipos de VPH.Se descubrió que las vías relacionadas con el sistema inmune estaban relacionadas con diferentes características de DE, incluyendo la desgranulación de neutrófilos, el factor de desprendimiento mieloide 88 y los receptores similares a los costos. Nuestros datos también sugieren que algunas características involucradas con la respuesta inmune pueden desempeñar un papel fundamental en el fomento del proceso de infección por VPH. De hecho, el estudio de la firma de células inmunes mostró niveles de actividad distintivos de varias células asociadas con el sistema inmune, incluyendo las células NKT, DC y Treg. Muchas de las características que se descubrió que estaban involucradas en lunares similares no fueron objeto de estudios evaluados previamente por amigos, lo que sugiere futuras direcciones y líneas de investigación que se centren en esas características individuales, así como en los patrones de expresión de los diferentes tipos de VPH.Se descubrió que las vías relacionadas con el sistema inmune estaban relacionadas con diferentes características de DE, incluyendo la desgranulación de neutrófilos, el factor de desprendimiento mieloide 88 y los receptores similares a los costos. Nuestros datos también sugieren que algunas características involucradas con la respuesta inmune pueden desempeñar un papel fundamental en el fomento del proceso de infección por VPH. De hecho, el estudio de la firma de células inmunes mostró niveles de actividad distintivos de varias células asociadas con el sistema inmune, incluyendo las células NKT, DC y Treg. Muchas de las características que se descubrió que estaban involucradas en lunares similares no fueron objeto de estudios evaluados previamente por amigos, lo que sugiere futuras direcciones y líneas de investigación que se centren en esas características individuales, así como en los patrones de expresión de los diferentes tipos de VPH.