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Volumen 7, Asunto 5 (2022)

Comentario

Patrón específico de metilación del ADN en el pollo Lampbrush

Alla Benjamín

La metilación del ADN, que interviene en el control de la transcripción y la replicación, la reprogramación del desarrollo, el silenciamiento de retroelementos y otras actividades genómicas, es un mecanismo regulador epigenético crucial. Para que se produzca el desarrollo embrionario durante el desarrollo de los mamíferos, debe crearse un determinado patrón de metilación del ADN en las células germinales. En otros animales, la metilación del ADN en las células germinales es menos conocida. Examinamos el metiloma unicelular de los ovocitos de diploteno de pollo para llenar este vacío. Desarrollamos una segmentación basada en la metilación del genoma del pollo y descubrimos promotores de genes metilados exclusivos de los ovocitos después de caracterizar exhaustivamente los patrones de metilación en estas células. Nuestros resultados demuestran que los patrones de metilación en estas células reflejan fielmente la distribución cromosómica observada en los tejidos somáticos, a pesar de la creación de una arquitectura genómica transcripcionalmente hiperactiva particular en los ovocitos de diploteno de pollo.

Mini reseña

Desarrollo de marcadores moleculares en especies de salvia medicinal

Yang Liu

Utilizamos la tecnología Illumina Hiseq 2500 para secuenciar los genomas de cloroplastos de Salvia bowleyana , S. splendens y S. officinalis con el fin de establecer a fondo sus relaciones evolutivas y crear marcadores moleculares para la clasificación de especies. S. bowleyana , S. splendens y S. officinalis tenían genomas de cloroplastos de 151.387, 150.604 y 151.163 pares de bases de longitud, respectivamente. Las áreas IR contenían los seis genes ndhB, rpl2, rpl23, rps7, rps12 e ycf2. Hay 29 repeticiones en tándem, 35 repeticiones de secuencia simple, 24 repeticiones de secuencia simple y 47, 49, 40 repeticiones intercaladas en los genomas de cloroplastos de S. bowleyana , S. splendens y S. officinalis , respectivamente. Las 23 especies de Salvia se pudieron distinguir por las tres secuencias intergénicas distintas (IGS) de rps16-trnQ-UUG, trnL-UAA-trnF-GAA y trnM-CAU-atpE. El análisis de la distancia genética permitió la identificación de 91 secuencias espaciadoras intergénicas en total. Las dos áreas IGS específicas (ycf3-trnS-GGA y trnG-GCC-trnM-CAU) exhiben los valores más altos de K2p entre las tres especies de Salvia bajo investigación. El árbol filogenético también demostró que las 23 especies de Salvia formaban un grupo monofilético. El descubrimiento de dos conjuntos de iniciadores de código de barras de ADN específicos del género. Los hallazgos proporcionarán una base sólida para comprender cómo se clasifican filogenéticamente las tres especies de Salvia . Además, las regiones intergénicas únicas pueden ofrecer el potencial de distinguir las especies de Salvia en función tanto del fenotipo como de la diferenciación de segmentos genéticos.

Comunicación corta

Conexiones del ADN con la lisozima

Nikolai Noskov

Se utilizaron AFM, elipsometría, tensiometría de superficie, reología dilatacional de superficie y espectroscopia de absorción por reflexión infrarroja (IRRAS) para investigar las interacciones del ADN con la lisozima en la capa superficial (AFM). Bajo una capa de lisozima dispersa, se inyectó una subfase acuosa con una solución concentrada de ADN. A diferencia de las interacciones del ADN con una monocapa de un polielectrolito sintético catiónico, donde las propiedades ópticas de la capa superficial cambiaron rápidamente después de la inyección de ADN, la elasticidad superficial dilatacional dinámica casi no cambió. Esto sugiere que no se formó una red continua de complejos de ADN/lisozima. El aumento relativamente rápido de las señales ópticas después de una inyección de ADN detrás de una capa de lisozima sugiere que la difusión regula la penetración del ADN. Las imágenes de AFM demuestran el desarrollo de hebras largas en la capa superficial a bajas presiones superficiales. A diferencia de una capa mixta de ADN y polielectrolitos sintéticos, el aumento de la compresión de la superficie da como resultado la aparición de pliegues y crestas en lugar de una red de agregados de ADN/lisozima. Es probable que las interacciones más débiles entre la lisozima y el ADN dúplex y la estabilización de bucles de nucleótidos desapareados en altas concentraciones locales de lisozima en la capa superficial sean las causas de la creación de agregados más desordenados.

Mini reseña

Los receptores de inmunoglobulina y el antígeno C aumentan el riesgo de rechazo hepático crónico

Miguel Bolarín

La eliminación hepática crónica (CR) se refiere a lo que sucede a la luz del hecho de que numerosos pacientes no responden a la inmunosupresión aumentada. Las interacciones de los receptores de inmunoglobulina similares a células asesinas naturales/antígenos leucocitarios humanos de clase I (KIR/HLA-I) contribuyen a la predicción de la alorreactividad de las células asesinas naturales (NK) e influyen en la eliminación crónica del aloinjerto hepático. No obstante, su importancia en la unión hepática con CR sigue siendo cuestionable. Los genotipos de KIR y HLA se concentraron en 513 trasplantes de hígado utilizando técnicas de oligonucleótidos específicos de la serie (PCR-SSO). Se examinaron y compararon los KIR, los genotipos del antígeno leucocitario humano C (HLA-C), las combinaciones de KIR y el ligando KIR/HLA en trasplantes generales y CR (n = 35) y sin eliminación crónica (NCR = 478). Las cualidades KIR inhibidoras (aKIR) en los receptores (rKIR2DS2+ y rKIR2DS3+) aumentaron la tasa de CR en comparación con los grupos NCR (p = 0,013 y p = 0,038). Las cualidades KIR inhibidoras (iKIR) en los receptores rKIR2DL2+ aumentaron fundamentalmente la tasa de CR en comparación con su ausencia (9,1% frente a 3,7%, p = 0,020). KIR2DL3 aumenta fundamentalmente la CR (13,1% frente a 5,2%; p = 0,008). No hubo efecto sobre el NCR. Se observó CR en los factores de confusión de HLA-I (MM). La deficiencia del ligando del donante (d) HLA-C2 (dC2−) aumenta la CR en relación con su presencia (13,1% frente a 5,6%; p = 0,018). Se observó un enorme incremento de CR en rKIR2DL3+/dC1−(p=0,015), rKIR2DS4/dC1−(p=0,014) y rKIR2DL3+/rKIR2DS4+/dC1−(p=0,006).

La supervivencia a largo plazo de los pacientes fue fundamentalmente menor en rKIR2DS1+rKIR2DS4+/dC1− a los 5-10 años posteriores a la reubicación. Este estudio muestra el impacto de las combinaciones rKIR/dHLA-C y las combinaciones de calidad aKIR en el crecimiento de CR y ligandos KIR2DS1+/C1 y el impacto de los ligandos KIR2DS4+/C1 en la supervivencia a largo plazo de los pacientes.

Perspectiva

Estimación de un estudio preliminar de la microestructura del hueso trabecular mandibular

Mohd Yusof

El objetivo de este estudio es doble: primero, asociar las características de cada uno de los límites de la microestructura ósea trabecular (TBM) con la edad secuencial y el sexo del individuo, trabajando posteriormente con la evaluación de los posibles cambios relacionados con la edad y el sexo en los límites de la microestructura ósea trabecular en la mandíbula; y segundo, evaluar los límites microestructurales trabeculares correspondientes a la edad ordenada. Se recuperaron de forma reflexiva veinte controles tomográficos registrados de barra cónica (CBCT) de un conjunto de datos de pacientes adultos con edades comprendidas entre los 22 y los 43 años. En la mandíbula, el volumen de interés incorporó el espacio entre los dientes entre el segundo premolar mandibular y el molar mandibular primario, así como el espacio trabecular debajo y entre los ápices. Utilizando el software Analyze Direct 14.0, las imágenes DICOM de los estudios CBCT se preprocesaron, cambiaron, dividieron utilizando una estrategia inteligente de límite de autocarga y se midieron. Además, se infirieron los límites de TBM y se realizó una investigación medible utilizando una prueba de relación de Pearson con dos colas. Ninguno de los límites mostró contrastes realmente tremendos (p>0,05) entre la edad ordenada y el sexo. Se encontraron conexiones negativas mediblemente críticas entre Tb. N (r=−0,489), BS/televisión (r=−0,527) y edad secuencial (p=0,029 y p=0,017, respectivamente). Solo Tb. N y BS/televisión mostraron una relación opuesta con la edad secuencial. Varias investigaciones han evaluado el diseño trabecular de los huesos maxilares, pero ninguna ha rastreado una conexión entre los límites trabeculares medidos y la edad ordenada. Los grabados computarizados creados por imágenes radiográficas pueden actuar como perfiles orgánicos para la recopilación de información.

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