Revista de medicina forense

Desarrollo de marcadores moleculares en especies de salvia medicinal

Abstract

Yang Liu

Utilizamos la tecnología Illumina Hiseq 2500 para secuenciar los genomas de cloroplastos de Salvia bowleyana , S. splendens y S. officinalis con el fin de establecer a fondo sus relaciones evolutivas y crear marcadores moleculares para la clasificación de especies. S. bowleyana , S. splendens y S. officinalis tenían genomas de cloroplastos de 151.387, 150.604 y 151.163 pares de bases de longitud, respectivamente. Las áreas IR contenían los seis genes ndhB, rpl2, rpl23, rps7, rps12 e ycf2. Hay 29 repeticiones en tándem, 35 repeticiones de secuencia simple, 24 repeticiones de secuencia simple y 47, 49, 40 repeticiones intercaladas en los genomas de cloroplastos de S. bowleyana , S. splendens y S. officinalis , respectivamente. Las 23 especies de Salvia se pudieron distinguir por las tres secuencias intergénicas distintas (IGS) de rps16-trnQ-UUG, trnL-UAA-trnF-GAA y trnM-CAU-atpE. El análisis de la distancia genética permitió la identificación de 91 secuencias espaciadoras intergénicas en total. Las dos áreas IGS específicas (ycf3-trnS-GGA y trnG-GCC-trnM-CAU) exhiben los valores más altos de K2p entre las tres especies de Salvia bajo investigación. El árbol filogenético también demostró que las 23 especies de Salvia formaban un grupo monofilético. El descubrimiento de dos conjuntos de iniciadores de código de barras de ADN específicos del género. Los hallazgos proporcionarán una base sólida para comprender cómo se clasifican filogenéticamente las tres especies de Salvia . Además, las regiones intergénicas únicas pueden ofrecer el potencial de distinguir las especies de Salvia en función tanto del fenotipo como de la diferenciación de segmentos genéticos.