Ciencia y terapia del cáncer

Las mutaciones sinónimas que aumentan el índice de adaptación del ARNt (tAI) generalmente se suprimen en los oncogenes humanos

Abstract

Duan Chu y Lai Wei

Antecedentes: Los diferentes codones sinónimos se decodifican a distintas velocidades durante la elongación de la traducción debido a la diferencia en la disponibilidad del ARNt, el índice de adaptación del ARNt a término (tAI). Los codones con valores de tAI más altos se traducen más rápido. Las mutaciones sinónimas no cambian el aminoácido (AA), pero a veces cambian el tAI. Esto significa que las mutaciones sinónimas pueden alterar la eficiencia de la traducción de los genes del huésped. En el campo del cáncer, las mutaciones sinónimas a menudo se ignoran automáticamente. Sin embargo, el aumento de la traducción de oncogenes o la disminución de la traducción de genes supresores de tumores (TSG) también podrían conducir a la oncogénesis incluso cuando las secuencias de proteínas no cambian. Estos cambios en el nivel de traducción podrían ser inducidos por mutaciones sinónimas.

Resultados y discusión: Descargamos los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) en poblaciones humanas. El estado ancestral se analiza de acuerdo con las alineaciones genómicas entre humanos, macacos y ratones. Descubrimos que en las poblaciones humanas normales, las mutaciones sinónimas derivadas que aumentan el tAI están fuertemente suprimidas en los oncogenes pero ligeramente favorecidas en TSG. En los oncogenes, los sitios de mutación con niveles de conservación más altos tienen más probabilidades de disminuir el tAI.

Conclusión: Nuestros resultados indican que las mutaciones sinónimas en el genoma humano no son estrictamente neutrales. La traducción potencialmente aumentada de oncogenes y la traducción disminuida de TSG causadas por mutaciones sinónimas se suprimen en poblaciones humanas normales. Esto es una evidencia indirecta de que los cambios de traducción inducidos por mutaciones sinónimas podrían estar relacionados con la oncogénesis y no deberían ignorarse en los estudios sobre el cáncer.