Ciencia y terapia del cáncer

Los codones de parada del gen TGF βRI modulan la actividad funcional de la estructura 3D y su susceptibilidad genética en el caso del tumor de Wilms

Abstract

Ajit Kumar Saxena, Veena Singh, Aprajita, Aniket Kumar, Meenakshi Tiwari, Pritanjali Singh, Chandan K Singh y Ramanuj K

Las variantes genéticas de los receptores del factor de crecimiento transformante beta tipo 1 ( TGF-βR1 ) están involucradas en la vía de señalización celular y sus mutaciones codifican aminoácidos involucrados en la estructura de la proteína no han sido definidas. El presente estudio evalúa la frecuencia de mutación del gen TGF-βR1 , la variación del número de copias (CNV) y la secuenciación de ADN para cambios de nucleótidos seguido de la predicción del modelo de proteína 3D para sitios de unión de ligando. Los casos clínicamente diagnosticados de tumor de Wilms se utilizaron para estudios genéticos utilizando RT-PCR para determinar la frecuencia de mutaciones genéticas, se observaron CNV y cambios en nucleótidos mediante secuenciación de ADN (método de Sanger). La frecuencia de mutación del gen TGF-βR1 fue del 18,18% observada en casos WT con respecto a los controles. De manera similar, el valor Tm (media) fue 90,70 y se desplazó a 91,0, mostrando diferencias significativas (p=0,24) y el IC al 95% varió entre 2,09-7,09 con variaciones en el número de copias que mostraron SD=0,37 y el IC al 95% 0,337- 0,906. Los datos de secuenciación revelan la aparición de dos secuencias de nucleótidos TGA→TCA y TGA→CCC, que traducen los aminoácidos serina y prolina, respectivamente, y se consideran como "codón de terminación". Se identificaron mutaciones adicionales en forma de inserción/deleciones y se predijo una estructura helicoidal 3-D para la capacidad de unión del ligando para desarrollar nuevas moléculas para terapias contra el cáncer basadas en la farmacogenómica.