Ciencia y terapia del cáncer

Un metaanálisis de la expresión genética de células tumorales de cáncer de colon y recto revela genes asociados con la tumorigénesis

Abstract

Rutvi Vaja

Antecedentes: Cada año, más de 12 millones de personas son diagnosticadas con cáncer colorrectal (CCR) y más de 600.000 personas mueren a causa de esta enfermedad, lo que la convierte en la segunda forma de cáncer más mortal. Este trabajo analiza la expresión genética diferencial en muestras de CCR y otros tumores glandulares para identificar cambios en la expresión que podrían contribuir al desarrollo de la tumorigénesis del CCR.

Métodos: Este trabajo define 13 firmas genéticas que representan cuatro tumores de CRC y otros 10 tumores glandulares que son de origen colónico. El análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes (GSEA) se utiliza para definir paneles de genes de CRC positivos y negativos a partir de genes de vanguardia identificados por GSEA utilizando dos firmas de CRC. Luego, GSEA se utiliza para verificar el enriquecimiento y la pertenencia de genes de vanguardia de los paneles de CRC en dos firmas de genes de CRC independientes. Luego, el análisis se extiende a cuatro firmas de tumores individuales y 10 glandulares. Los genes más asociados con la tumorigénesis de CRC se predicen mediante la intersección de la pertenencia de los genes de vanguardia identificados por GSEA en todas las firmas.

Resultados: Se observa un enriquecimiento significativo entre las firmas de identificación de genes de CRC, a partir de las cuales se definen los paneles de CRC positivos (55 genes) y negativos (77 genes). Se observa un enriquecimiento significativo no aleatorio entre los paneles de genes de CRC y las firmas de verificación, de las cuales 54 genes sobreexpresados ??y 72 subexpresados ??se comparten entre los bordes principales. Considerando otras muestras de tumores glandulares individualmente y en combinación con CRC, se observa un enriquecimiento no aleatorio significativo entre estas firmas. Ocho genes de la familia de transportadores de solutos como ( SLC25A32, SLC22A3, SLC25A20, SLC36A1, SLC26A3, SLC9A2, SLC4A4 y SLC26A2 ) del panel de CRC se compartieron comúnmente entre todos los bordes principales de las firmas genéticas, independientemente del tipo de tumor colónico.

Conclusión: Este metanálisis identifica cambios en la expresión génica asociados con el proceso de tumorogénesis del CCR. Estos cambios pueden contribuir al desarrollo de tratamientos terapéuticos disponibles para los pacientes con CCR.