Ciencia y terapia del cáncer

Determinación del número óptimo de núcleos en función de la evaluación de anticuerpos mediante microarrays tisulares en el cáncer de pulmón de células no pequeñas

Abstract

Jason A. Wampfler, Marie Christine Aubry, Ping Yang, Darren L. Riehle, C. Dilara Savci-Heijink, Sumithra Mandrekar y Wilma L. Lingle

Antecedentes: Los microarrays de tejido (TMA) se han utilizado comúnmente en la investigación traslacional para examinar rápidamente numerosos biomarcadores en muestras grandes. Una preocupación importante ha sido la evaluación adecuada de los biomarcadores afectados por la heterogeneidad intratumoral y por los objetivos moleculares. Métodos: Nuestro estudio fue diseñado para responder a una pregunta fundamental: ¿cómo definen los investigadores los núcleos óptimos para muestrear al diseñar un estudio de TMA para minimizar el sesgo de muestreo y el artefacto del núcleo? Comparamos los resultados de tinción de un portaobjetos de tejido de sección completa con el TMA virtual y del TMA real con el TMA virtual. Resultados: Se demostró que tres núcleos eran óptimos para marcadores como TTF-1 y p53, pero no se pudo determinar un número óptimo de núcleos para marcadores como Ki-67 debido a la mala representación del TMA de todo el tejido. Conclusión: Proponemos que antes de utilizar TMA para analizar muestras grandes, en particular con una heterogeneidad significativa dentro de la muestra, una investigación preliminar utilizando un TMA virtual podría ayudar a decidir los marcadores objetivo que se probarán para obtener resultados válidos y valiosos.