Revista de SIDA e investigación clínica

Tropismo de correceptores determinado mediante ensayo genotípico en el VIH-1 circulante en Cuba

Abstract

Vivian Kourí, Yoan Alemán, Dianne Díaz, Lissette Pérez, Celia M Limia, Yudira Soto, Yenisleidys Martínez, Yoanna Baños, Yaniris Caturla, Jorge Campos, Lilia M Ortega, Jorge Pérez y Ulrich Hengge

Introducción: Los virus con tropismo R5 predominaron en el momento de la infección inicial por VIH-1 y en aproximadamente el 50% de los pacientes en la etapa avanzada de la enfermedad se produce un cambio al tropismo X4.

Objetivo: Asociar diferentes variantes del VIH-1 cubano con el uso de correceptores y la implicación para el uso de inhibidores de correceptores.

Metodología: Se determinó el subtipo viral del VIH-1 en 42 individuos cubanos utilizando los algoritmos COMET V.2, Rega subtyping toolV.3 y análisis filogenético. El tropismo del correceptor se predijo utilizando el algoritmo geno2pheno [correceptor]. Además, también se analizaron todas las secuencias cubanas del bucle V3 del VIH-1 depositadas previamente en la base de datos de Los Alamos para comparar el subtipo y el tropismo del correceptor.

Resultados: Los subtipos detectados con mayor frecuencia fueron CRF20–23–24_BG (35,7%), subtipos B (33,3%) y CRF19_cpx (14,3%) cuando se analizaron las regiones pol y V3. En general, el 61,9% de las muestras fueron virus R5 y el 14,3% fueron X4. Los virus CRF19_cpx fueron con mayor frecuencia cepas R5X4/X4 (5/6 muestras, p=0,009) o X4 (3/6 muestras, p=0,019). El análisis adicional de 359 secuencias env cubanas demostró que solo el 29,3% fueron virus X4. Curiosamente, el 43,6% de los CRF19_cpx fueron virus R5X4/X4, lo que confirma la asociación previa (p=0,011). Los aminoácidos característicos del bucle V3 (V/T12, R13, Q18, V19, G22) se identificaron con frecuencias más altas en los virus CRF19_cpx que en el subtipo B (p<0,0001).

Conclusión: CRF19_cpx es una forma genética con una alta proporción de virus con tropismo X4. Esto respalda la mayor patogenicidad de CRF19_cpx, lo que podría conducir a una rápida progresión de la enfermedad. La alta frecuencia de tropismo X4 en pacientes infectados con CRF19_cpx implicaría que los antagonistas de CCR5 podrían ser ineficaces en la mayoría de estos pacientes.