Revista de sangre y linfa

Comparación de los cambios transcriptómicos en pacientes con mieloma múltiple más jóvenes y mayores a partir de los datos de ARN-Seq del estudio MMRF-CoMMpass

Abstract

Merve Keskin

Antecedentes: Las diferencias relacionadas con la edad en el mieloma múltiple (MM) se estudian en el contexto clínico y genómico; sin embargo, los cambios en el transcriptoma aún no se han determinado. El objetivo de este estudio es identificar los genes que se expresan de manera diferente en grupos de pacientes jóvenes y mayores y examinar la relación de estos genes con las vías biológicas y los medicamentos que se pueden utilizar.

Métodos: Se utilizaron los datos de ARN-Seq de la cohorte MMRF CoMMpass (n=634) para analizar los genes expresados ??de forma diferencial entre pacientes jóvenes y mayores. Se realizó un análisis de enriquecimiento del conjunto de genes KEGG y del término GO utilizando paquetes R. Se detectaron interacciones fármaco-gen utilizando DGIdb.

Resultados: A nivel global, 523 genes (366 sobreexpresados, 157 sobreexpresados) se expresaron de manera diferencial (p<0,05) en pacientes jóvenes. Se enriquecieron 220 términos GO, en su mayoría relacionados con vías de regulación inmunitaria. El conjunto de genes de “interacción entre receptores de citocinas” se enriqueció en KEGG GSEA. Entre las diferencias de expresión más altas, se identificaron genes involucrados en la regulación inmunitaria (FCGR1A, FCER1G, TLR2), genes protooncogénicos conocidos (BCL2, FGR) y genes bajo investigación por asociación con varios cánceres (RGL4, MT-RNR1, ETS2, ENPP3, FUT7, NTNG2, PRAM1). Se identificaron fármacos asociados con las vías afectadas por estos genes.

Conclusión: Una mayor investigación de los genes expresados ??diferencialmente en pacientes jóvenes puede arrojar luz sobre nuevas opciones de tratamiento.