Ciencia y terapia del cáncer

Análisis bioinformáticos de la determinación del perfil de ARNm tras la supresión de Ezrin en el carcinoma de células escamosas del esófago

Abstract

Bingli Wu, Chunquan Li, Jianjun Xie, Zepeng Du, Liewei Luo, Jianyi Wu, Pixian Zhang, Liyan Xu y Enmin Li

La ezrina participa en múltiples funciones de las células cancerosas. En este estudio, los genes expresados ??diferencialmente (GED) identificados a partir del perfil de expresión de ARNm después de la supresión de la ezrina en el carcinoma de células escamosas de esófago (CCE) se analizaron mediante múltiples métodos bioinformáticos para lograr una comprensión integral. El enriquecimiento de la ontología genética encontró términos significativos relacionados con la inmunidad, la respuesta a estímulos, la unión a la matriz extracelular y la transducción de señales. El cuadro de anotación funcional mostró que, excepto las categorías GO, estos GED estaban anotados por 72 términos de categorías funcionales. Los análisis de subvías revelaron que los GED estaban involucrados en 36 subvías, lo que superaba el enriquecimiento de la vía tradicional. Los análisis del promotor mostraron patrones de secuencia específicos y factores de transcripción que corresponden a la co-regulación negativa y co-regulación positiva de los GED. MNB1A, DOF2, PBF, YY1, PRRX2, UBX y ARNTAHR co-regulan los genes regulados a la baja, mientras que GATA2, ZNF42, deltaEF1, MYCN y ARNT co-regulan los genes regulados al alza. Este artículo proporciona un flujo de trabajo para una mejor comprensión de las funciones de la supresión de Ezrin en ESCC mediante los análisis bioinformáticos de sus DEG.