Revista de SIDA e investigación clínica

Aplicación del análisis ambiguo para determinar infecciones recientes de VIH-1 en una población de hombres que tenían sexo con hombres en China

Abstract

Xiaoyan Bai, Hongwei Zhang, Wei Shao, Lan Li, Zheng Zeng y Hao Wu

Objetivo: Distinguir la infección reciente por VIH-1 (≤ 300 días) de la infección prolongada por VIH-1 (>300 días) en la población de hombres que tenían sexo con hombres (HSH) de China. Analizamos el cambio a lo largo del tiempo en la proporción de nucleótidos ambiguos en las secuencias plasmáticas de los pacientes. Planteamos la hipótesis de que este método podría utilizarse para determinar infecciones recientes.

Métodos: Se reconocieron secuencias del VIH-1 y datos clínicos de HSH desde junio de 2007 hasta septiembre de 2010. Todas las secuencias se obtuvieron mediante amplificación y secuenciación de un solo genoma. Se utilizó el recuento de ambigüedades del VIH para calcular la proporción de nucleótidos ambiguos y se determinaron los valores de corte óptimos para identificar la infección reciente mediante el análisis de la característica del operador del receptor (ROC).

Resultados: Se reconocieron un total de 188 secuencias de 150 pacientes (38 pacientes fueron muestreados dos veces en diferentes puntos temporales), consistentes en 118 secuencias del subtipo CRF01_AE y 70 secuencias del subtipo B. Los valores de corte óptimos para la determinación de la infección temprana por VIH-1 en los subtipos CRF01_AE y B fueron 0,31% y 0,347%, respectivamente. La sensibilidad, especificidad, valores predictivos positivos y negativos fueron 76,5%, 55%, 89,3% y 32,4% para el subtipo CRF01-AE (P=0,005), 80,6%, 62,5%, 94,3% y 29,4% para el subtipo B (P=0,017), respectivamente. El área bajo la curva ROC (AUCROC) fue de 0,652 (IC del 95 %, 0,520-0,783, P = 0,03) y 0,75 (IC del 95 %, 0,622-0,878, P = 0,022) para el subtipo CRF01 -AE y B, respectivamente.

Conclusiones: La proporción de nucleótidos ambiguos puede ser un buen marcador para distinguir la infección reciente de la infección a largo plazo por VIH-1 con un alto valor predictivo positivo en la población de HSH de China.