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Avances en el desarrollo de marcadores moleculares para la salvia medicinal

Abstract

Yang Liu

Utilizamos la tecnología Illumina Hiseq 2500 para realizar la secuenciación del genoma del cloroplasto de Salvia boweyana, S. splendens y S. officinalis . Este esfuerzo tuvo como objetivo dilucidar sus relaciones evolutivas de manera integral y establecer marcadores moleculares para la identificación de especies. Los genomas del cloroplasto de estas especies exhibieron longitudes de 151,387, 150,604 y 151,163 pares de bases, respectivamente. Dentro de estos genomas, las regiones de repetición invertida (IR) albergaban seis genes: ndhB, rpl2, rpl23, rps7, rps12 y ycf2. En términos de estructuras repetidas, S. bowleyana, S. splendens y S. officinalis mostraron 29 repeticiones en tándem, 35 repeticiones de secuencia simple y 24 repeticiones de secuencia simple, junto con 47, 49 y 40 repeticiones intercaladas, respectivamente. En particular, tres secuencias intergénicas distintas (IGS)-rps16-trnQ-UUG, trnL-UAA-trnF-GAA y trnMCAU-atpE-permitieron la diferenciación de las 23 especies de Salvia. El análisis de distancia genética identificó un total de 91 secuencias espaciadoras intergénicas, y las regiones ycf3-trnS-GGA y trnG-GCC-trnM-CAU demostraron los valores de K2p más altos entre las tres especies de Salvia bajo investigación. Además, nuestro análisis filogenético reveló que las 23 especies de Salvia formaban un grupo monofilético. Este estudio también reveló el desarrollo de dos conjuntos de iniciadores de código de barras de ADN específicos de cada género. Estos hallazgos sirven como una base sólida para comprender la clasificación filogenética de las tres especies de Salvia. Además, las regiones intergénicas distintivas tienen el potencial de distinguir las especies de Salvia en función de los rasgos fenotípicos y la diferenciación de segmentos genéticos.

Descargo de responsabilidad: este resumen se tradujo utilizando herramientas de inteligencia artificial y aún no ha sido revisado ni verificado

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